Inokulering är en process där mikroorganismer, celler eller andra ämnen medvetet introduceras i en organism eller odlingsmiljö för medicinska, forsknings- eller diagnostiska syften.
Inokulering används inom medicin och forskning för att introducera smittämnen, celler eller vacciner i en organism eller kulturmiljö. Det är en metod som används vid vaccination för att framkalla immunitet, eller inom laboratoriemiljöer för att studera mikroorganismer och deras effekter. Inokulering är också centralt inom mikrobiologi för att odla bakterier eller svampar under kontrollerade förhållanden för diagnostiska ändamål eller forskning. Tekniken kräver noggrannhet för att säkerställa sterilitet och önskat resultat.